免費SSL憑證與付費SSL憑證最大的差別如下：
1.SSL憑證申請及安裝過程中，需要提供相關伺服器資料及進行安裝，若您使用的是免費SSL憑證你就必需自行研究，而向戰國策購買SSL皆可全部幫您完成到好。
2.SSL憑證頒發的驗證嚴謹程度及企業資訊揭露的多寡將直接影響此張SSL憑證給予客戶的信任程度，一般免費SSL憑證採用的是較簡單的信件驗證，只要能收到信件就等於通過驗證。
3.免費SSL憑證有限期限通常為 90 天，會每30天需要經常更新、安裝等繁瑣步驟。
4.根據電子簽章法「SSL憑證機構對因其經營或提供認證服務之相關作業程序，致當事人受有損害，或致善意第三人因信賴該憑證而受有損害者，應負賠償責任」，而免費SSL憑證並不提供此規範。